基于线粒体控制区分析固始鸡遗传多样性和起源进化

为了探索固始鸡的遗传多样性和母系起源，以73个固始鸡为实验材料，通过PCR扩增和测序技术获得固始鸡-线粒体DNA控制区的完整序列，并用19个红色草原鸡序列构建了系统发育树。结果表明，固始鸡mtDNA控制区的总长度为1231或1232bp，1231bp人在859 BP处有C缺失。在73个个体中发现了15个单核苷酸多态基因座，共6个单倍型。遗传多样性分析表明，固始鸡的平均核苷酸差异（k）为5.287，Pi的平均核苷酸差异（Pi）为0.004 290.00013，单倍型多样度的平均核苷酸差异（Hd）为0.6000.034。系统发育分析表明，这六个单倍型可分为两个分支：A和C。分支A与原鸡滇南亚种（Gallus Gallus spadiceus）聚集，分支C与原鸡印度亚种（Gallus Gallus murghi）、原鸡滇南亚种（Gallus Gallus spadiceus）、原鸡指名亚种（Gallus-gallus-gallus）和原鸡印尼亚种（Gallus-gallus-bankiva）聚集，推测固始鸡可能有多个母系起源。本研究为从分子水平探索固始鸡遗传资源的保护、开发和利用提供了参考。