单增李斯特菌生物被膜形成不同时段sRNA的筛选

作者:委慧玲; 齐玉梅; 张武宏; 田常青; 宋晨; 李天昊; 史文静; 祁国军; 魏衍全; 薛惠文; 苟惠天
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为了筛选与单增李斯特菌生物膜形成相关的非编码小RNA(sRNA)(LM),并初步探索sRNA及其靶基因的生物学功能,本研究通过高通量测序、实时荧光定量PCR和比较LM浮游菌研究了生物膜形成不同时期的sRNA差异,筛选与LM生物膜形成相关的sRNA,预测sRNA的靶基因,并分析它们在生物膜形成中可能的调控途径。结果表明,与LM浮游菌相比,预测了38个新的sRNA,其中sRNA00085、sRNA00019和sRNA00058在LM生物膜形成中显著上调,sRNA00054、sRNA00081和sRNA00111显著下调。sRNA的三个上调和三个下调的靶基因可能参与碳代谢、不同环境中的微生物代谢、核糖体。葡萄糖代谢、氨酰基-tRNA生物合成和脂肪酸代谢的六条调节途径是潜在的LM生物膜调节器。研究结果为深入研究LM生物膜的sRNA调节机制提供了理论依据。