大肠杆菌在葡萄糖和甘油碳源培养条件下的基因表达谱分析

作者:朱梦黎; 张玉娟
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[目的]研究葡萄糖和甘油碳源对大肠杆菌(Escherichia coli)基因表达谱的影响。[方法]通过基因表达数据库,GEO下载了GSE、2037、高通量测序和数据集GSE156143的基因芯片数据集。这两个数据集中的葡萄糖和甘油碳源样本分别在差异表达基因进行了筛选。将筛选出的数据进行组合后,构建了GO函数富集分析、KEGG路径富集分析和蛋白质相互作用网络。[结果]701例。差异表达基因主要集中在小分子分解代谢、碳水化合物运输和趋化性等生物过程、细胞器、细菌鞭毛和甲基受体趋化蛋白复合物等细胞成分、离子跨膜、碳-水化合物结合和肌肉活动等分子功能,以及微生物代谢、,不同环境中的ABC和转运体相关路径。此外,筛选出的14个核心基因在鞭毛合成和趋化性中起作用。[结论]在葡萄糖和甘油碳源培养条件下,大肠杆菌具有不同的基因表达模式。这14个与趋化性和鞭毛合成有关的基因有助于进一步揭示大肠杆菌响应不同营养环境变化的分子调控机制。