应用16S rDNA测序分析肝、肾脓肿的病原菌特点

目的比较16S　rDNA测序和传统培养在肝脏和肾脓肿病原菌检测中的价值，分析肝脏和肾脓肿病原菌的特征和成分差异。方法收集2019年12月至2020年12月在一家医院接受经皮穿刺引流术的32例患者（24例来自肝脓肿，8例来自肾脓肿）的脓肿引流液。通过传统培养和16S　rDNA测序对病原体进行了鉴定，并对16SrDNA测序结果中肝脏和肾脓肿的菌群特征进行了比较和分析。结果脓肿引流液传统文化检测结果阳性26例（81.25%），阴性6例（18.75%）（其中肝脓肿3例，肾脓肿3例）。16S　rDNA测序的阳性率为100%。肝脏和肾脓肿组微生物的植物区系丰度相似。叠加直方图和主成分分析显示，两组之间的病原体组成存在显著差异。线性判别分析表明，肝脓肿组菌群主要以普罗特斯、肠杆菌目、肠杆菌科和克雷伯菌属为特征，而肾脓肿组菌群主要以丛毛单胞菌科、分枝杆菌科、变形杆菌属、短芽孢杆菌、根瘤菌属、毛螺菌属、纤毛菌属、嗜糖假单胞菌属、分枝杆菌属、Thermicanus菌属和Saccharimonadaceae菌属为特征。结论16S　rDNA测序法在检测肝脏和肾脓肿病原体方面优于传统培养法。肝脏的成分与肾脓肿组病原菌不同。16S　rDNA测序是深入了解肝脏和肾脓肿病原菌特征的有效方法。