水稻氨基酸转运蛋白OsATLa亚家族的生物信息学及表达分析

氨基酸态氮是水稻（Oryza　sativa L.）使用的重要氮形态之一，其运输和分配由转运蛋白氨基酸负责，它属于不同的亚科。其中，OsATLa亚科（氨基酸转运蛋白样a）由7个成员组成，但对该家族的相关研究较少。这项研究对OsATLa亚家庭成员进行了生物信息学和OsATLa亚的表达分析。结果表明，Os和ATLa的氨基酸数量与等电点不同。其中，OsATL1的分子量最大，为51.76，kD和OsATL7的理论等电点最高，为9.43。跨膜结构分析显示，OsATL1、OsA、TL5和OsATL6有10个跨膜结构域，而Os和ATL2只有4个跨膜结构域，预计上述成员的C末端和N端位于细胞外。OsATL3、OsATL4和OsATL7有11个跨膜结构域，C端和N端位于质膜两侧，Os、ATL5和OsATL6关系密切。保守的基序分析表明，除了Os和ATL2，所有成员中都发现了五个保守的基序，而OsATL2号缺乏其他成员的第一和第三个保守基序。保守位点分析发现LAV、VF、llfg存在大量保守位点，包括mxxpaxxxxl和其他保守区域。顺式作用元件扫描在OsATLa基因启动子发现了易受压力、激素和光反应影响的元件。miRNA预测和蛋白质磷酸化位点分析也表明，家族成员受多种因素调控。基因表达分析表明，该家族成员以不同方式被激素诱导，包括OsATL1号、OsATL3、OsATL4OsATL6、OsATL7等成员参与了茉莉酸（jasmonic acid，JA）和脱落酸（abscisic acid，ABA）的信号通路。本研究为后续深入研究OsATLa亚家庭成员的功能和分析水稻氮素利用机制提供了参考。