人参皂苷生物合成相关基因RgRg2BBE克隆及生物信息学分析
作者:李傲; 刘思章; 王义; 王康宇; 朱蕾; 李俐; 姜悦; 王艳芳
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克隆了与人参皂苷Rg2合成有关的重要酶基因pgrg2bbe的全长cDNA序列,并通过在线软件分析了该基因编码的蛋白质的理化性质、结构域、亚细胞定位和系统发育。结果表明,PgRg2BBE基因cDNA序列的长度为1638bp,编码545氨基酸。PgRg2BBE蛋白质的分子量为60967.10,Da为8.88,不稳定性指数为34.04。据预测,该蛋白质是一种稳定的亲水性跨膜蛋白蛋白,主要由a-螺旋和无规则卷曲组成。PgRg2BBE蛋白包含FAD_binding_4和BBE,后者位于叶绿体,包含24个氨基酸序列信号肽。系统发育树发现它与智利茄子的遗传关系最为密切。氨基酸序列多重比对发现RgRg2BBE包含四个保守的基序。进一步与拟南芥-At-BBE家族蛋白质进行同源序列比对,发现它们同时具有四个保守基序(rkygl、MGED、FWAIRGG和FPEI),这项研究为人参皂苷Rg2生物合成机制的研究提供了新的见解。
