耐药基因blaTEM-1、blaIMP-3、fosA3多重重组聚合酶扩增(RPA)快速检测方法的建立和应用

作者:朱凝瑜; 贺泽; 梁倩蓉; 郑晓叶; 丁雪燕; 曲道峰
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为了建立一种同时检测多种耐药基因的快速检测方法,利用blatem-1、blaIMP-3和fosA3基因保守序列设计了特异性引物。在优化反应条件后,建立了用于上述三个耐药基因恒温检测的多重重组聚合酶扩增(Nipol)方法。条件优化结果表明,当引物浓度为480 mmol/L、37个恒温反应和20个min时,所建立的方法检测效果最好。该方法可以扩增携带blatem-1、blaIMP-3和fosA3基因的菌株的条带。阴性菌株无条带,特异性高。blaTEM-1和blaIEM-3基因的最低检测限为1.810~1拷贝/L,fosA3基因的最低检测限为1.810~2拷贝/L。采用多种RPA方法检测了从浙江省水产养殖环境和生物中分离的400株菌株。从blaTEM-1、blaIEM-3和fosA3-检出率的水产养殖水中分离到的菌株分别为81.00%(81/100)、11.00%(11/100)和29.00%(29/100),blaIEM-3和fosA3-检出率的分离菌株分别为73.67%(221/300)、1.33%(4/300)和23.33%(70/300),与常规PCR基本一致。所建立的RPA方法具有操作简单、响应快、检出限低、结果可靠等优点。适用于多种耐药基因的快速检测。为快速查明养殖产业链各个环节的耐药基因谱,减少耐药基因的传播,保障食品安全提供技术支持。