东方白鹳粪便总DNA五种提取方法的比较
作者:武芳婷; 吴弘; 赵大鹏
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本研究比较了DNA在东方白鹳(Ciconia boyciana)粪便中的五种提取方法,以期为后续物种性别鉴定和DNA条形码鉴定提供合适的方法。十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB法)、十二烷基磺酸钠裂解法(SDS法)、Tiangen试剂盒法、Qiagen试剂盒法和异硫氰酸胍法(GuSCN法)被用于从天津动物园东方白鹳提取新鲜粪便。比较了五种提取方法在不同水浴(破壁)时间条件下获得的DNA浓度和DNA纯度(A260/A280值),以及PCR扩增的稳定性。这五种提取方法都可以从粪便中提取DNA基因组,但由于水浴(破壁)时间的影响,提取的DNA基因组质量不同。其中GuSCN法提取效果最好,SDS法提取效果较差。使用从GuSCN法提取的DNA,在1小时的水浴(破壁)时间内,可以成功地进行PCR扩增和物种鉴定。总之,Gu SCN法是最简单、高效、可靠和低成本的DNA提取东方白鹳粪便的方法。
