鸭茅响应水淹胁迫的miRNA差异表达分析

作者:杨兴云; 乔丹丹; 张雅洁; 王少青; 任俊才; 李明阳; 屈明好; 尚盼盼; 杨成; 黄琳凯; 曾兵
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淹水胁迫是制约西南地区高羊茅产量和品质提高的主要环境因素,已成为不可忽视的非生物胁迫。鉴定与果树耐涝相关的功能基因,探索其调控机制,是创新果树种质、提高鸭茅耐涝性的必要途径。以耐涝品种滇北为实验材料,分别在淹水胁迫0、8和24小时后,利用IlluminaHiseq测序平台对果园草叶片进行测序。结果表明,208差异表达基因(DEGs)在洪水胁迫下被鉴定。经筛选,38个基因上调,34个基因下调,占差异表达基因的34.62%。差异表达基因鸭茅洪水胁迫下的滇北主要属于五个miRNA基因家族:miR166、miR167、miR159、miR396和miR156。根据靶基因对差异miRNA的预测,以及GO和KEGG在靶基因的功能分析,发现这些目标基因主要参与植物的应激反应过程,如细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路和Th17细胞分化,为进一步揭示洪水胁迫下鸭茅的分子调控机制提供了研究线索。