甘蓝型油菜重金属ATP酶基因Bn-HMA3的克隆与生物信息学分析
作者:贺晓岚; 王建伟; 王根平; 郝保军; 郭宏伟
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植物重金属转运ATP酶(HMA)参与植物细胞对重金属的吸收、转运、富集、分配和解毒。本研究通过同源克隆PCR扩增了bn-hma3基因,分别命名为bn-hma3-my88和bn-hma3-ny868。结果表明,bn-hma3-my88和bn-hma3-ny868的开放阅读框长度为2bp,编码763个氨基酸。相应蛋白质的分子量分别为81.97和81。等电点分别为5.69和5.61。该蛋白质序列包含六个反式膜结构基因。亚细胞定位预测分析表明,该基因主要分布在细胞质中。功能结构域分析结果证实,两种蛋白均含有保守的重金属相关(HMA)、E1-E2 ATP酶和水解酶结构域,属于P型ATP酶家族。多重序列比对和系统发育树分析结果表明,bn-hma3-my88和bn-hma3-ny868与芜菁HMA3 (XP 009137892.1)的氨基酸序列相似性最高,分别为96.73%和96.47%,与高山HMA3 (kag7545642.1)的氨基酸序列相似性超过87%。本研究结果为进一步研究bn-hma3-my88和bn-hma3-ny868基因在重金属吸收、转运和积累过程中的功能和机制提供了基因资源。
