鸭茅响应水淹胁迫的miRNA差异表达分析

在中国西南地区鸭茅，洪水压力是限制产量和质量提高的主要环境因素。它已成为一种不容忽视的非生物胁迫。鉴定鸭茅耐涝相关功能基因并探索其调控机制，是创新鸭茅种质资源、提高鸭茅耐涝性的必要途径。以高山耐涝品种“滇北”为实验材料，采用Illumina-hiseq测序平台，分别对淹水胁迫0、8和6h后高山叶片的小RNA进行测序。结果表明，在淹水胁迫下共鉴定出208个差异表达基因。经筛选，38个基因表达上调，34个基因表达下调，占差异表达基因的34.62%。洪水胁迫下“滇北”鸭茅的差异表达基因主要属于五个miRNA基因家族：mir166、mir167、mir159、mir396和mir156。通过对差异性miRNA的靶基因预测和靶基因的go和KEGG功能分析，发现这些靶基因主要参与植物胁迫响应过程，如细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路和Th17细胞分化，这为进一步揭示鸭茅在淹水胁迫下的分子调控机制提供了研究线索。